Preferencialmente, a calagem e a adubação com fosfato natural não devem ser realizadas ao mesmo tempo. O fosfato natural deve ser aplicado isoladamente e pelo menos de 45 a 60 dias antes de qualquer calagem. Isto não é válido para os fosfatos reativos, tais como para o fosfato natural de Gafsa, Arad e da Carolina do Norte, que não precisam de acidez na mesma proporção para acelerar a reação com o solo. Nesses casos, podem-se observar os critérios normais de época de aplicação da calagem: 60 a 90 dias antes da adubação.